Nuestro Core Facility de Proteómica y Genómica cuenta con una plataforma integrada por las áreas de proteómica, genómica, cromatografía y bioinformática. Cada una de estas plataformas se encuentra compuesta por la mejor y más robusta tecnología, investigadores altamente capacitados, además de una diversa variedad de técnicas montadas que aseguran el más alto estándar en cada uno de nuestros servicios.
A continuación, te contamos sobre uno de nuestros flujos de trabajo: Button-up proteomics (DIA-Método masivo)
El método de Data Independent Acquisition (DIA) requiere de la realización de dos pasos. En primer lugar, es necesario crear una librería espectral por medio del método de Data Dependent Acquisition (DDA) que será utilizada posteriormente. Sobre la base de esto, contaremos con la máxima cantidad posible de espectros dentro de una muestra en específico.
En segundo lugar, es necesario realizar una corrida de LC-MS/MS en modalidad dia-PASEF. A grandes rasgos, comparte una metodología de extracción y digestión de proteínas similar a la de DDA, teniendo variaciones en la captura de datos proteómicos y análisis bioinformáticos.
A partir de nuestra librería espectral creada previamente, identificaremos las proteínas contenidas en los resultados DIA, además su intensidad, conteo espectral y número de péptidos presentes en las muestras iniciales, obteniendo el resultado final.
Una de las grandes ventajas de nuestra plataforma proteómica timsTOF Pro y nuestro flujo de trabajo basado en dia-PASEF, es su desempeño en proyectos complejos y que requieren de una alta cantidad de corridas de espectrometría de masas, debido a que la técnica DIA resulta especialmente beneficiosa para la identificación masiva de proteínas en muestras de diversa naturaleza.
Para conocer más en detalle cada uno de nuestros servicios, visita nuestra página, sección Core Facility.