El Core Facility de MELISA Institute es una división de servicios destinada a brindar soluciones personalizadas a investigadores y empresas en el campo de las tecnologías de análisis masivo de proteínas y ácidos nucleicos a través de ciencias ómicas como la genómica, la transcriptómica, la proteómica y la bioinformática.
Actualmente, nuestros servicios para investigadores están orientados en estas 4 áreas (Proteómica, Genómica, Cromatografía y Bioinformática) y 7 áreas de Investigación y Desarrollo para la generación de nuevas tecnologías aplicadas a la industria en áreas como ciencias de la vida, agricultura, alimentación, silvicultura, biomedicina, microbiología y minería.
De acuerdo con nuestro CEO y Core Facility Manager, el Dr. Cristian Vargas; los servicios de investigación en nuestra área de proteómica se basan en el método de bottom-up proteomics y sus aplicaciones como la Label-Free Quantification (LFQ), el Tandem Mass Tagging (TMT), Sequential Window Acquisition of all Theorical Fragment ion spectra Mass Spectrometry (SWATH MS) , Selected Reaction Monitoring (SRM), peptidómica de novo, análisis de modificaciones postraduccionales, metaproteómica, secuenciación de anticuerpos, entre otros.
En el área de genómica, nuestros servicios de investigación son: secuenciación de genoma completo RNA-Seq, secuenciación de genoma de novo, secuenciación dirigida de regiones genómicas de interés, secuenciación y análisis de exoma, PCR en tiempo real para analizar la expresión génica, análisis metagenómicos , genotipado / genotipado dirigido y análisis microbiológicos.
Nuestros servicios de investigación en cromatografía son: purificación de proteínas recombinantes (IMAC, GST), cromatografía de exclusión molecular, cromatografía de intercambio iónico (catiónico y aniónico) y purificación de anticuerpos.
En el área de bioinformática, nuestros servicios incluyen: anotación y enriquecimiento funcional de secuencias de proteínas, análisis cuantitativo de proteínas bajo diferentes metodologías, análisis de vías, análisis de modificaciones postraduccionales y análisis de secuencias de proteínas y péptidos.
Cerrando la lista, en el campo de la investigación y el desarrollo, ofrecemos soluciones integrales adaptadas a los requerimientos de las industrias agrícola, alimentaria, forestal, biomédica, microbiológica y minera, a través de contratos de tecnología.
Instrumentos de primera calidad para investigación
Nuestra plataforma de proteómica se compone de un espectrómetro de masas tims TOF Pro de Bruker Daltonics acoplado a un nanocromatógrafo NanoELUTE, un cromatógrafo AKTA Avant 25 de General Electric, un espectrómetro infrarrojo de detección directa para la cuantificación de péptido-proteínas y un liofilizador HyperVAC-Max-VC2200 HyperCool con concentrador giratorio. La plataforma de genómica se compone de un secuenciador masivo NEXTSeq 500 de Illumina, un termociclador Step One Plus de Applied Biosystem, un fluorómetro Qubit de Thermo Fisher Scientific y un sistema de electroforesis capilar Qsep100 BiOptics.
La plataforma bioinformática está compuesta por un servidor de análisis que consta de un procesador dual Intel Xeon E5-2650 v4 con 24 subprocesos de procesamiento cada uno (48 subprocesos), 512 Gb de RAM y 50 Tb de almacenamiento. Además, contamos con el software Peaks Studio X + de Bioinformatics Solutions Inc. y software especializado en proteómica como Skyline, MSFragger, MaxQuant, Perseus entre otros. El equipamiento de nuestro Core Facility, unido a la dedicación de nuestro personal de laboratorio, permite al Instituto MELISA ofrecer experiencias de servicio de primer nivel para empresas e investigadores.